为贯彻落实党中央、国务院关于深化医药卫生体制改革总体部署，加快推进医院高质量发展，持续改善医疗卫生服务，不断满足人民群众日益增长的医疗卫生服务需求，医院成立深化改革领导小组，党委书记李银山、党委副书记、院长周玮任组长。截至2022年9月15日，医院召开3次深化改革领导小组会议，周玮院长亲自带领小组成员不断探索新时代深化医改新路径，大胆创新深化改革领导小组组织架构设置，为各项改革任务有序推进奠定组织基础。
医院原有的组织架构仅设置了深化医院改革工作领导小组及领导小组办公室，为建立深化医院改革工作协调机制，定期对改革推进情况进行指导和督查，为领导小组提供决策依据，小组成员通过调查研究、头脑风暴等方式，增加设置了深化医院改革工作组，工作组下设综合协调组、岗位薪酬组、运营绩效组、学科建设组、创新发展组五个小组。综合协调小组，主要负责协调各工作小组推进建立健全现代医院管理制度、公立医院高质量发展等相关政策、文件涉及医院改革任务有效落实，总结提炼医院改革和建立健全现代医院管理制度工作成效和经验等；岗位薪酬组，主要负责落实岗位管理制度和综合改革周期性岗位分级评价及聘任等；运营绩效小组，主要负责研究学习国家及自治区相关政策文件，建立完善医院运营管理组织架构体系和规章制度等；学科建设小组，主要负责研究贯彻落实国家、自治区关于学科建设相关政策文件，对医院院区及学科建设进行顶层设计和总体规划，制定完善学科建设有关制度等；创新发展小组，主要负责贯彻落实国家、自治区关于科技创新工作方面的法律、法规、规章和政策，起草、完善与医院发展相适应的制度， 推动医院科技创新体系和科技服务体系建设等。
医院创新深化改革组织架构新模式是健全运营管理体系，推动医院运营管理规范化、精细化的具体实践。周玮院长表示：“医院的深化改革，是站在新的历史起点推开的，体制机制将更加灵活，在绩效分配、学科建设、人才引进、制度完善等方面也会更加法制化、科学化、专业化，进而全面助推医院高质量发展。”
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